De Emmanuel Gemeente gelooft in de vijfvoudige bediening (Efeze 4:11) en meervoudig leiderschap (oudsten en opzieners) en de bediening van diakenen (ondersteunende bedieningen). In het Nieuwe Testament lezen we over leiderschap binnen een plaatselijke gemeente en dat er oudsten (meervoud) moesten worden aangesteld (Handelingen 14:23 en Titus 1:5,6). Zowel oudsten, opzieners en diakenen worden in de Emmanuel Gemeente aangesteld door het bestuur. 
Het bestuur van de gemeente bestaat uit de voorganger, 1 oudste en 3 bestuursleden.

De taakverdeling is als volgt:

• Rabinder Janki (Voorganger)
• Paul Remy (Oudste)

Bestuursleden

• Jim Remy (bestuurslid tevens penningmeester/secretariaat)
• Han Krijgsman (bestuurslid)
• Frans Sopacua (bestuurslid)